neuroConstruct está sendo desenvolvido no Laboratório de Prata no Departamento de Neurociência, Fisiologia e Farmacologia da UCL. a neuroConstruct foi projetada para simplificar o desenvolvimento de redes complexas de neurônios biologicamente realistas, ou seja, modelos que incorporam morfologias dendríticas e conduções realistas da membrana celular. É implementado em Java e gera arquivos de script para os simuladores NEURON e GENESIS, com suporte para outras plataformas de simulação (incluindo PSICS, MOOSE e PyNN) em estágios avançados de desenvolvimento. Ele usa as mais recentes especificações neuroml, incluindo MorphML, ChannelML e NetworkML. O desenvolvimento deste software foi possível com financiamento do Wellcome Trust, do Medical Research Council e do Projeto Sinapse da UE. Algumas das principais características da neuroconstrução são: * a neuroconstrução pode importar arquivos de morfologia no formato GENESIS, NEURON, Neurolucida, SWC e MorphML para inclusão em modelos de células ou redes únicas, ou células mais abstratas também podem ser construídas manualmente. * Criação de redes de neurônios baseados em condutância posicionadas em 3D * Padrões complexos de conectividade entre grupos celulares podem ser especificados para as redes * Os scripts de simulação podem ser gerados para simuladores baseados em NEURÔNIO, GÊNESIS, MOOSE, PSICS e PyNN (nota: nem todos os projetos podem ser gerados para cada simulador) * Mecanismos celulares biofisicamente realistas (sinapses/mecanismos de canal) podem ser importados de arquivos de script nativos (*.mod ou *.g) ou criados a partir de modelos usando o ChannelML * Geração automática de código para registro de dados de simulação e visualização/análise de dados em neuroConstrução * As séries de simulação gravadas podem ser visualizadas e gerenciadas através da interface Simulation Browser * Uma interface de scripting baseada em Python pode ser usada para controlar a geração e execução do modelo, permitindo que várias simulações sejam executadas para otimização de modelos de células e rede
história da versão
- Versão 1.6.0 postado em 2012-08-23
Detalhes do programa
- Categoria: Educação > Ciência
- Editor: University College London
- Licença: Livre
- Preço: N/A
- Versão: 1.6.0
- Plataforma: windows