NDKmol - molecular viewer 0.97

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NDKmol - Visualizador molecular para Android == Sobre == NDKmol é um visualizador molecular para Android. Você pode ver estruturas tridimensionais de proteínas, ácidos nucleicos e pequenas moléculas. O NDKmol suporta a maioria das representações comuns para moléculas, como fita, traço, vara, esfera e linha. O NDKmol também suporta operações de simetria; conjuntos biológicos e embalagem de cristal podem ser exibidos. Você pode pesquisar e baixar estruturas do PDB RCSB e do NCBI Pubchem. NDKmol tem quase a mesma funcionalidade que o GLmol, que é escrito em WebGL/Javascript e é executado em navegadores da Web. Você pode tentar GLmol em http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Características == * Leia o arquivo PDB ou SDF/MOL * Girar/Traduzir/Ampliar modelo por dedo * Representações - Linha - Vara - Esfera (raio van der Waals) - Traço de carbono alfa - Fita (Fina ou Grossa) - Strand - Tubo de fator B - Escada de ácido nucleico - Linha de ácido nucleico - solvente 'estrelas' * Suavização de folhas beta * Coloração - Por cadeia - Por estrutura secundária (quando definida em registros SHEET/HELIX) - Por Elementos - Gradação (também conhecida como chainbow) - Fator B - polar/não polar * Cristalografia - Célula da unidade de exibição - Mostrar embalagem de cristal (quando definido na seção REMARK) - Exibir montagem biológica (quando definido na seção REMARK) == Como usar == Quando lançado, o NDKmol carrega automaticamente o Porin (PDBID: 2POR) como exemplo. Você pode girar a molécula pelo seu dedo. Para ampliar ou traduzir a molécula, pressione o botão MENU no telefone/tablet e selecione o modo. Gestos de dois dedos também são apoiados. Todo o resto pode ser feito a partir do MENU. Para carregar outros arquivos PDB, coloque o arquivo no diretório "PDB" do cartão SD e selecione o comando "Abrir" no MENU. Você também pode baixar estruturas diretamente do servidor web RCSB PDB e NCBI PubChem. Selecione "Pesquisar e Baixar" no menu. == Contato == O site do projeto está localizado em http://webglmol.sourceforge.jp/ . Você pode obter códigos-fonte para este programa a partir daqui. Comentários e sugestões de http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou [email protected] === Aviso de LICENÇA === O NDKmol em si é licenciado sob a Licença Pública Geral GNU da seguinte forma. No entanto, os arquivos PDB incluídos como exemplos estão em condições diferentes. Consulte http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Visualizador Molecular para Android (C) Direitos autorais 2011, biochem_fan Este programa é um software livre: você pode redistribuí-lo e/ou modificar sob os termos da Licença Pública GNU Menor Geral, conforme publicado por a Free Software Foundation, seja a versão 3 da Licença, ou (a sua opção) qualquer versão posterior. Este programa é distribuído na esperança de que ele seja útil, mas sem qualquer garantia; sem mesmo a garantia implícita de COMERCIALIZAÇÃO OU APTIDÃO PARA UM PROPÓSITO ESPECÍFICO. Veja o GNU Menor Licença Pública Geral para mais detalhes. Você deveria ter recebido uma cópia da Licença Pública Geral GNU Menor

história da versão

  • Versão 0.97 postado em 2018-03-25
    Download fixo de PDB do PDB RCSB
  • Versão 0.95 postado em 2015-05-02
    Versão 0.95 (20150503),* Fixo "Pesquise PubChem" para trabalhar com atualização recente do servidor,* Espero que esta versão deva funcionar no Android 5. (Testado no Android 5.1 no Nexus 7),Se não, envie-me detalhes.,* Pode abrir arquivos de mapa MRC (BETA)Para usuários de dispositivos sem botão MENU:,deve haver uma maneira de abrir MENU, por exemplo, pressionando,botão HOME longo. Consulte o manual do seu dispositivo.
  • Versão 0.92 postado em 2013-07-02
    Várias correções e atualizações

Detalhes do programa