Jmol Molecular Visualization 1.1

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Sobre Jmol Molecular Visualization

Jmol é um projeto de visualização molecular de código aberto (http://jmol.sourceforge.net) tradicionalmente envolvendo um aplicativo Java autônomo ou um applet incorporado em uma página da Web. Jmol já está disponível em tablets Android.

Os usuários da Atividade de Visualização Molecular Jmol podem baixar e investigar em seu tablet Android mais de 60.000 estruturas biomoleculares diretamente do Protein Data Bank (PDB) por palavra-chave ou ID PDB e mais de 40.000.000 estruturas exclusivas do Instituto Nacional de Saúde do Instituto Nacional de Câncer (NIH/NCI) usando uma grande variedade de identificadores químicos, incluindo números de registro CAS, chaves InChI, nomes comerciais, nomes comuns e nomes em formato IUPAC, entre outros. (Para obter uma lista completa, consulte http://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure.) Arquivos de qualquer outro site disponível na Internet que possam ser lidos pela Jmol também podem ser carregados.

A Jmol Molecular Visualization Activity é uma implementação quase completa de tela sensível ao toque do Jmol que permite a entrada de linha de comando dos comandos Jmol (ver http://chemapps.stolaf.edu/jmol/docs), bem como uma variedade de modos de visualização simples predefinidos. Renderizações adicionais incluem uma gama completa de visualizações para cristais (células unitárias, operadores de simetria, aviões Miller, por exemplo), uma grande variedade de superfícies, incluindo superfícies van der Waals, superfícies acessíveis a solventes, cavidades e superfícies moleculares, e orbitais atômicos e moleculares.

Características especiais da versão Android do Jmol incluem uma conexão com o giroscópio, permitindo iniciar a fiação simplesmente movendo o tablet de forma natural (veja http://www.youtube.com/watch?v=JPwvCmD5IDg e http://www.youtube.com/watch?v=D7uOkhoJ0Oc).

Esta atividade está em desenvolvimento ativo. O feedback é muito apreciado.